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Arrêts maladie : des durées désormais plafonnées, quel impact pour votre exploitation ?

Combien de temps un salarié peut-il être en arrêt maladie ? Depuis le 1er septembre 2026, 2 décrets plafonnent la durée des arrêts maladie prescrits par les médecins, précisant la façon dont vous pouvez anticiper et organiser les absences de vos salariés.

Depuis le 1er septembre 2026, un arrêt maladie initial ne peut plus dépasser 31 jours, et une prolongation, 62 jours. Le médecin conserve néanmoins la possibilité de prescrire une durée plus longue, à condition de la justifier. Pour les renouvellements d’au moins 3 mois, le médecin traitant peut également solliciter l’avis du service médical de la MSA.

Pour vous, employeur, ces plafonds apportent une meilleure visibilité pour organiser un remplacement ou répartir la charge de travail — sans toutefois constituer une garantie : une dérogation reste possible, et plusieurs prolongations successives peuvent se cumuler. La durée maximale d’indemnisation par la MSA, elle, ne change pas.

Vos obligations habituelles restent identiques : réception du volet employeur, suivi des indemnités journalières complémentaires versées, organisation de la visite de reprise…

Pour faire le point sur votre situation, votre FDSEA reste votre interlocuteur privilégié.

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Date de dernière mise à jour :

28 septembre, 2026